فريق بحثي من جامعة كربلاء ، بتسجيل عزلة فطرية في البنك الجيني العالمي Gen Bank

 

قام فريق بحثي من جامعة كربلاء ، بتسجيل عزلة فطرية للفطر Sclerotinia sclerotiorum  في البنك الجيني العالمي Gen Bank   )و هو قاعدة بيانات تسلسل الجينات ، ويعد بنك الجينات جزءا من التعاون الدولي لقاعدة بيانات تسلسل النوكليوتيدات، في اليابان ، والأرشيف الأوروبي للنوكليوتيدات ، وبنك الجينات في NCBI

(National Center for Biotechnology Information )     ،

وهي جزء من المعاهد الوطنية للصحة في الولايات المتحدة، حيث تتبادل هذه المنظمات الثلاث البيانات يوميا  . (

تألف الفريق البحثي من :

أ.د.بان طه محمد ( كلية التربية للعلوم الصرفة) … رئيسا

أ.د.عباس مطرود باشي( كلية العلوم الطبية التطبيقية ) … عضوا

د . عقيل نزال العبيدي ( كلية الزراعة ) … عضوا

 السيد هشام علي مهدي( طالب الدكتوراه / كلية التربية للعلوم الصرفة) … عضوا

و يعد هذا التسجيل الاول للفطر في العراق  ، و قد سميت العزلة MMBIRAQ  حيث يشير MM  الى الحرف  الاول  من  الاسم  الثالث   للباحثين ،  بان طه محمد وهشام علي مهدي ،  وB  ( تشير الى محافظة بابل ) لان العزلة الفطرية من محافظة بابل ثم (IRAQ) العراق ، علما بان تسجيل العزلة تضمن معلومات تفصيلية تشير الى مكان العمل في ناحية الحسينية في قسم الوقاية / جامعة كربلاء ، نظرا لكونه مكان اجراء استخلاص الحامض النووي للفطر وتاكيد تشخيصه جزيئيا، حيث  تم تشخيص الفطر مظهريا ومجهريا بالاعتماد على المفاتيح التصنيفية المعروفة ، ومن ثم اجراء تفاعل البلمرة المتسلسل  PCR  (polymerase chain reaction)  ، وباستخدام البوادئ ITS4 , ITS1  ( Internal transcribed spacer)

و قد استخدم برنامج Blast  وهو عبارة عن برنامج يجد مناطق التشابه بين التسلسل البيولوجي ويقارن التسلسل للنيوكليوتيدات او البروتينات مع قواعد الببيانات التسلسلية وبحسب دالة احصائية، وتمت مقارنة التتابع النيوكليوتيدي لحزمة الحامض النووي للفطر مع البيانات المتوفرة في قاعدة البيانات NCBI . وجد من خلال المقارنة بان اعلى نسبة تشابه وراثي كانت مع عزلة للفطر معزولة من ايطاليا والبالغة 99%  في حين كانت الاكثر تباعدا عن المعزولة من كندا . وهنالك تفاصيل سوف يتم نشرها ضمن بحوث مستلة من اطروحة الدكتوراه للطالب المذكور ان شاء الله ……